通过调节特定的细胞因子，如生长因子和趋化因子，可以调控干细胞的定向分化，以期望它们在卵巢囊肿区域产生有益的影响。

CRISPR-Cas9等基因编辑技术被用于修改干细胞的基因，以消除导致囊肿形成的遗传因素。