在选择进行干细胞注射治疗的医院时，应当综合考虑医院的专业水平、医生的经验、技术的先进性以及患者的个人健康状况等因素。曲阜市作为山东省的一个城市，拥有多家医疗机构，但要特别强调的是，选择进行此类治疗前，应当充分了解相关医疗政策、法规，并通过正规渠道获取信息。

首先，建议选择具有国家卫生健康委员会批准的干细胞临床研究资质的医院。这类医院通常拥有更完善的医疗设施、更专业的医疗团队以及更严谨的医疗管理体系。在曲阜地区，可能包括但不限于曲阜市人民医院、曲阜市中医院等，这些医院在医疗资源和服务上相对较为全面。

其次，选择医生时，应关注其专业背景、临床经验以及在干细胞治疗领域的研究贡献。经验丰富的医生能够提供更为精准的诊断和个性化的治疗方案。

再次，考虑到干细胞治疗的复杂性和风险性，患者应与医生充分沟通，了解治疗的全过程、预期效果、潜在风险及可能的副作用，确保自己对治疗有清晰的认识和接受度。

最后，切勿轻信夸大疗效或承诺“包治百病”的宣传，干细胞治疗虽然在某些领域展现出潜力，但仍然存在一定的不确定性和风险。因此，选择正规、合法的医疗机构进行治疗是保障安全和效果的关键。

总之，在曲阜选择进行干细胞注射治疗的医院时，应遵循科学、审慎的原则，通过多方比较和咨询专业人士意见，做出最适合自己的选择。