在选择进行干细胞移植治疗糖尿病的医疗机构时，您需要考虑的因素包括医疗水平、医生的专业背景、设施条件以及患者评价等。上海市奉贤区虽然在医疗资源上可能不如市中心集中，但仍然有提供高质量医疗服务的医疗机构。

建议您首先关注上海市内知名的综合性医院或专业糖尿病医院，这些机构通常具有更丰富的临床经验和更先进的技术设备。例如，复旦大学附属中山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院等，这些医院在糖尿病及干细胞治疗领域都有较高的声誉和研究实力。

选择医疗机构时，可以参考以下几个关键点：

专业团队：了解该机构是否拥有一支由内分泌科专家、移植科专家组成的多学科团队，以确保患者获得全面、个性化的治疗方案。

技术实力：询问该机构在干细胞移植治疗糖尿病方面的技术优势，包括使用的是自体干细胞还是异体干细胞，以及治疗的具体流程和技术特点。

患者评价：可以通过互联网、医疗论坛或咨询已经接受过治疗的患者，了解他们的治疗效果和体验，以此作为参考。

医疗保障：确认该机构是否提供完整的医疗保障服务，包括术前评估、手术过程、术后康复指导以及长期跟踪随访。

最后，建议您在决定之前，与多家医疗机构进行咨询和比较，结合自身情况做出最合适的选择。同时，考虑到治疗的费用、保险覆盖情况以及个人健康状况等因素，综合考量后再做决定。记得，在任何医疗决策过程中，都应与专业的医疗人员密切沟通，遵循医嘱，切勿轻信未经证实的治疗方法或夸大其词的宣传。