干细胞疗法在某些医学研究中被探索用于治疗卵巢囊肿，但目前仍处于实验阶段。理论上，干细胞具有自我修复和分化的能力，可能有助于卵巢组织的再生和恢复。对于某些类型的卵巢囊肿，如功能性囊肿，由于它们可能与内分泌失调有关，干细胞或许能通过调节体内激素水平来缓解症状。

然而，大规模临床试验尚未证实其确切疗效，且这种方法还存在技术难题、安全性和有效性等问题。因此，对于卵巢囊肿的治疗，传统方法如药物治疗、手术切除等仍然是主要选择，应在专业医生指导下进行。任何新型医疗技术的尝试都应在严格监管下进行。