治疗小脑萎缩的医院选择主要取决于患者的地理位置、医疗资源、专业水平以及治疗方案。以下是一些在中国具有较高声誉的小脑萎缩治疗医院：

1. 北京天坛医院：神经内科在国内享有盛誉，对于小脑萎缩等神经系统疾病有深入研究和丰富的临床经验。

2. 上海复旦大学附属华山医院：神经内科实力雄厚，对于小脑萎缩的诊断和治疗有很高的水平。

3. 广州市第一人民医院：神经内科是广东省重点学科，在小脑萎缩的治疗方面有较好的技术积累。

4. 华西医院（四川大学华西医院）：神经内科是国内神经科学中心，对小脑萎缩等疑难杂症有独到见解。

5. 长春中医药大学附属第一医院：中医治疗小脑萎缩也有一定的特色，如针灸、中药等方法可能提供辅助治疗。

请根据自身情况选择离家近且具备相应诊疗能力的医院，同时，早期诊断和综合治疗对于小脑萎缩患者尤为重要。务必咨询专业医生，制定个体化治疗方案。