治疗肾盂肾炎的医院选择主要取决于患者的地理位置、医疗资源和专业水平。以下是一些在中国有较高声誉的肾病专科医院，供您参考：

1. 北京协和医院：作为中国医学研究机构，其肾脏内科在肾盂肾炎的诊治方面具有丰富的经验和先进的技术。

2. 上海瑞金医院：肾脏科实力雄厚，设备齐全，对肾盂肾炎的诊断和治疗有很高的水准。

3. 广东省人民医院：肾脏病研究所是华南地区肾病诊疗的重要基地，对于肾盂肾炎的治疗效果显著。

4. 浙江大学医学院附属第一医院：肾脏病科在全国享有盛誉，对肾盂肾炎的治疗有着深入的研究和丰富的临床经验。

5. 复旦大学附属华山医院：肾脏科是国内科室之一，拥有国际先进的诊疗设备和技术。

以上医院均为国内医疗机构，但具体选择还需结合您的实际情况，如病情严重程度、医保覆盖等因素。建议您提前咨询医院的专家，根据医生的建议进行选择。