干细胞治疗小儿脑萎缩的原理主要基于其自我复制和分化的能力。干细胞是一种具有高度潜能的细胞，它们可以在特定条件下转化为身体内的各种细胞类型，包括神经元和胶质细胞。在小儿脑萎缩的情况下，由于部分脑组织受损或丧失，导致神经元减少和功能障碍。

通过干细胞疗法，医生会将健康的干细胞移植到患者体内，这些干细胞会在体内寻找并替换已经受损或死亡的神经元。它们能够分化为新生的神经元，修复受损的神经网络，促进神经再生，并分泌生长因子，刺激周围环境中的神经细胞再生和重建。同时，干细胞还能帮助改善炎症反应，减轻神经元损伤后的瘢痕形成，从而改善脑部功能。

干细胞疗法目前还处于临床试验阶段，效果和安全性需要进一步研究和验证。尽管如此，它展示出巨大的潜力，为治疗小儿脑萎缩等神经系统疾病提供了一种新的可能性。