更年期综合征是一种由于女性激素水平下降导致的生理和心理变化，而干细胞移植作为治疗手段在理论上可能有助于缓解某些症状，但目前这还处于研究阶段，并非常规临床疗法。如果干细胞移植被用于治疗更年期综合征，其住院时间会根据多种因素决定。

首先，移植过程可能需要全身麻醉，手术后恢复期因个体差异可能从几天到几周不等。其次，移植后的观察期也很重要，以监测患者对新细胞的接受情况以及可能出现的副作用。此外，干细胞疗法可能需要多次移植，每次之间可能需要间隔一段时间进行。

总的住院时长可能会在数周到几个月之间，具体取决于患者的健康状况、治疗方案和医生的建议。然而，任何医疗决策都应在专业医生的指导下进行，因为干细胞治疗在更年期综合征中的有效性及安全性还有待进一步研究和验证。