治疗药物性甲状腺炎的医院选择应考虑多个因素，包括医院的专业水平、设备条件、医生经验以及服务质量等。以下列举几家在中国有较高声誉的医院，供您参考：

1. 北京协和医院：作为国内医疗机构，其内分泌科在甲状腺疾病治疗方面具有丰富的经验和先进的技术。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：内分泌科实力雄厚，对于药物性甲状腺炎的诊治有着深入研究。

3. 广东省人民医院：该医院内分泌科在全国享有盛誉，对药物性甲状腺炎的治疗效果显著。

4. 浙江大学医学院附属第一医院：该医院内分泌科是浙江省的重点学科，对于药物性甲状腺炎的诊疗水平高。

5. 复旦大学附属华山医院：作为中国医院之一，华山医院内分泌科在甲状腺疾病领域有很高的声誉。

请根据您的地理位置和实际需求，结合医院的具体情况选择最适合您的医院。在就医前，提前预约并咨询专业医生，了解详细的治疗方案。