治疗肺脓肿的医院选择主要取决于患者所在地区和病情严重程度。以下是一些在中国享有较高声誉的肺脓肿治疗医院：

1. 北京协和医院：作为医疗机构，北京协和医院呼吸内科在全国范围内，对于肺部疾病，包括肺脓肿，有丰富的临床经验和先进的诊疗技术。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：该医院呼吸科在国内具有地位，设备和技术都处于前沿，对肺脓肿的诊断和治疗效果优秀。

3. 广东省人民医院：广东省人民医院呼吸内科在全国有很高声望，特别是在肺部感染性疾病治疗方面有着丰富的经验。

4. 成都市公共卫生临床医疗中心：作为西南地区的大型综合性医院，其呼吸科在肺脓肿等肺部疾病的治疗上颇具实力。

5. 武汉同济医院：作为华中地区的重要医疗机构，同济医院的呼吸科在肺脓肿治疗方面也表现出色。

以上医院的选择需要根据患者的具体情况，包括病情、交通便利性等因素综合考虑。建议患者就医前咨询专业医生或进行详细咨询。