甲状腺功能减退（甲减）的治疗需要在专业的内分泌科医生指导下进行，选择医院时应考虑以下几个因素：

1. 医院资质：大型综合性医院或三甲医院通常设有内分泌科，设备齐全，医疗技术先进。例如北京协和医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院等都是国内内分泌疾病诊疗中心。

2. 医疗团队：选择有丰富经验的内分泌专家团队，他们对甲减的诊断和治疗有深入研究，能提供个性化的治疗方案。

3. 设备与技术：现代化的检查设备和技术对于疾病的诊断和治疗至关重要，比如核医学科的同位素扫描，能帮助准确判断病情。

4. 服务质量：良好的服务环境和患者反馈也是选择医院的重要因素，可以咨询已就诊过的患者或者查阅医院的评价。

5. 地理位置：考虑到就医的便利性，选择离自己住所或工作地点近的医院会更方便。

总之，选择医院时，要综合考虑医院的专业水平、医疗资源、医生经验和患者口碑等因素，以确保得到治疗效果。