干细胞治疗卵巢囊肿是一种新型的生物医学疗法，它利用人体自身的干细胞来治疗疾病。干细胞具有自我复制和分化的能力，能够转化为各种类型的细胞，包括卵巢细胞。在卵巢囊肿的治疗中，医生可能会通过体外或体内移植特定类型的干细胞，如间充质干细胞或胚胎干细胞，让它们在特定环境下分化为健康的卵巢组织，替代或修复受损的卵巢功能，从而可能减少囊肿的形成或缩小其体积。

这种方法的优势在于无需进行传统手术，减少了创伤，且有可能避免了免疫排斥反应。然而，干细胞治疗卵巢囊肿仍处于研究阶段，其疗效、安全性以及应用方式等方面还需要进一步的临床试验验证。目前，对于大部分卵巢囊肿，常规治疗方法仍然是药物治疗或手术，具体情况需根据患者的具体病情和医生的建议来决定。