治疗脑栓塞后遗症的医院选择，主要取决于医院的专业水平、设备条件、医生经验以及服务质量。在中国，一些大型综合性医院和神经内科专科医院在治疗此类疾病方面具有较高的声誉和实力，例如北京天坛医院、上海复旦大学附属华山医院、广州珠江医院、南京鼓楼医院等。

这些医院拥有的神经外科和神经内科专家团队，配备了先进的医疗设备和技术，能够提供全方位的诊疗服务，包括药物治疗、物理疗法、康复训练等，对于脑栓塞后的康复治疗有着丰富的经验和良好的效果。

具体选择哪家医院，还需要考虑患者的具体情况，如所在地区、交通便利性等因素。建议在就医前咨询医生或亲友的推荐，并结合医院的公开信息进行评估。同时，患者的积极配合和坚持治疗也是非常关键的。