治疗甲状腺炎的医院选择，主要取决于医院的专业水平、设备条件以及医生的经验。在中国，一些大型综合性医院和内分泌科专科医院在甲状腺疾病治疗方面具有较高的水平，例如北京协和医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、中山大学附属第一医院等。这些医院的内分泌科医生团队专业，诊疗设备先进，能够提供全面且个性化的治疗方案。

然而，选择医院时还需考虑你的地理位置和个人方便。如果你所在地区有三甲医院，在就诊前，建议你可以先进行网络咨询或者电话咨询，了解医院的专家团队、诊疗技术以及患者评价，这样可以帮助你做出更合适的选择。

无论选择哪家医院，重要的是找到一位专业的内分泌科医生，他们对甲状腺疾病的诊断和治疗有着丰富的经验，这是决定治疗效果的关键。