干细胞调节肌肉萎缩的作用机制主要涉及到其自我复制和分化的能力。干细胞，尤其是多能干细胞，具有分化为各种细胞类型的潜力，包括肌细胞。当肌肉组织受到损伤或萎缩时，干细胞会被激活，通过多种信号传导途径，如生长因子和细胞外基质的交互作用，引导它们定向分化为肌肉细胞，补充损伤部位，促进肌肉再生。

干细胞可以通过分泌细胞因子，如胰岛素样生长因子（IGF-1）和转化生长因子β（TGF-β），来刺激肌肉细胞增殖和分化。同时，它们还能通过修复受损的血管网络，改善营养供应，从而支持新生肌肉的生长。此外，干细胞还能通过免疫调节作用，减轻炎症反应，有利于肌肉修复。

然而，目前干细胞治疗肌肉萎缩的效果仍处于临床研究阶段，尽管在动物模型和早期临床试验中显示出积极迹象，但大规模、长期的安全性和有效性还需进一步验证。未来，随着技术的进步，干细胞疗法有望成为治疗肌肉萎缩疾病的一种潜在策略。