干细胞治疗脑血栓后遗症的原理主要基于其独特的再生和分化能力。脑血栓后，部分脑组织可能因缺血、缺氧而受损，导致神经元死亡和功能丧失。干细胞，特别是神经干细胞，具有自我复制和多向分化潜能，能够迁移到损伤部位并转化为所需的神经细胞类型，如神经元、星形胶质细胞或少突胶质细胞。

当注入到脑内后，干细胞可以：

1. 增殖：通过分裂产生新的神经细胞，补充因血栓导致的细胞损失。

2. 分化：转变为功能性的神经元或支持细胞，恢复受损区域的神经网络。

3. 促进血管新生：干细胞分泌生长因子，刺激受损区域的血管再生，改善局部血流，有利于营养物质供应和废物排除。

4. 抗炎与免疫调节：干细胞还能通过抑制炎症反应，减少神经炎症对损伤修复的负面影响。

尽管干细胞疗法展现出巨大潜力，但目前仍处于临床试验阶段，其安全性和有效性需要进一步研究和验证。