干细胞改善肌肉萎缩的原理主要基于其独特的自我更新和分化能力。肌肉萎缩通常是由于神经损伤、疾病或遗传因素导致肌肉细胞（肌纤维）的损失或功能障碍。干细胞，特别是多能干细胞（如胚胎干细胞或成体干细胞），具有再生和修复的能力。

当注入到肌肉组织中时，干细胞可以分化为肌肉细胞，包括骨骼肌细胞和运动神经元，从而补充受损或死亡的肌肉细胞。这个过程称为肌源性分化。干细胞通过释放生长因子和细胞因子，促进局部微环境的修复，改善炎症反应，以及刺激新生血管形成，从而有利于肌肉再生和功能恢复。

干细胞还可以通过免疫调节作用，减少肌纤维坏死后的免疫反应，防止进一步的肌肉损伤。干细胞治疗肌肉萎缩的潜力在于其能够激活自身的修复机制，重建肌肉组织结构，恢复肌肉功能，为肌肉萎缩患者的康复提供新的可能。然而，这一领域的研究仍在发展阶段，需要更多的临床试验来验证其安全性和有效性。