干细胞治疗在改善甲状腺功能异常方面主要基于其自我更新和分化能力。甲状腺是内分泌系统的重要器官，主要分泌甲状腺激素调节新陈代谢。当甲状腺发生疾病，如甲亢或甲减时，其功能可能会受损。

干细胞，特别是成体干细胞，具有多向分化潜能，能够转化为甲状腺细胞。当注入到甲状腺组织中，这些干细胞可以定向分化为正常甲状腺上皮细胞，替换损伤或死亡的细胞，从而恢复甲状腺的正常功能。这一过程涉及到细胞增殖、分化和修复机制，通过生成新的甲状腺细胞，调控甲状腺激素的合成和分泌，进而改善甲状腺激素水平的异常。

干细胞疗法可能还通过调节免疫反应和炎症，间接改善甲状腺功能。它们能够减轻炎症反应，减少自身免疫攻击对甲状腺的损害，有利于疾病的康复。

干细胞疗法在临床应用上仍处于探索阶段，需要进一步的研究来验证其安全性和有效性。