干细胞，特别是造血干细胞，具有自我更新和分化为多种细胞类型的潜能。在治疗系统性红斑狼疮（SLE）这样的自身免疫性疾病中，干细胞疗法主要通过以下几个原理发挥作用：

1. **免疫调节**：干细胞可以分化为调节性T细胞和自然杀伤细胞，这些细胞能够抑制过度活跃的免疫反应，减少攻击自身组织的异常抗体和免疫细胞。

2. **细胞替换**：移植健康的干细胞可以替换受损或耗尽的免疫细胞，帮助重建正常的免疫耐受，降低炎症水平。

3. **修复损伤组织**：干细胞能够定向分化为特定的细胞类型，如皮肤、肾脏或关节细胞，用于修复因SLE引起的组织损伤。

4. **抗炎作用**：一些干细胞如间充质干细胞，可以通过分泌抗炎因子，减轻红斑狼疮患者的炎症反应。

干细胞治疗SLE仍处于临床试验阶段，因为需要解决技术难题，如如何保证移植的安全性和有效性，以及如何避免免疫排斥等问题。尽管如此，干细胞疗法展示出了巨大的潜力，为SLE等疾病的治疗提供了新的可能。