治疗过敏性咳嗽的医院选择主要取决于您所在的城市和具体的医疗资源。以下是一些在中国专门治疗呼吸系统疾病，包括过敏性咳嗽的医院推荐：

1. 北京协和医院：作为中国医疗机构，其呼吸内科在过敏性疾病的诊治上有着丰富的经验和先进的技术。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：该医院呼吸科在全国享有盛誉，对于过敏性咳嗽的诊断和治疗非常专业。

3. 广州市第一人民医院：该医院呼吸内科在过敏性疾病的治疗方面有很高的水平，配备了先进的诊疗设备。

4. 成都市第二人民医院：这是一家以呼吸疾病为特色科室的医院，对过敏性咳嗽有深入研究和治疗。

5. 浙江大学医学院附属第一医院：其呼吸内科在过敏性疾病的研究和治疗上处于国内地位。

请根据您的地理位置和实际情况，选择离您较近且口碑良好的医院进行就诊。同时，记得提前预约并咨询医生关于治疗方案和预防措施。