治疗纤维肌痛综合征的医院选择，主要取决于医院的专科特色、医生的专业水平和治疗设备。在中国，一些大型综合性医院或疼痛科、风湿免疫科、神经内科等专业科室有较好的治疗经验。例如：

1. 北京协和医院：作为国内医疗机构，其风湿免疫科在纤维肌痛综合征的诊治上有着丰富的经验和先进的技术。

2. 上海瑞金医院：风湿免疫科在国内享有盛誉，对于纤维肌痛综合征的诊疗也有一定的研究。

3. 广州中山大学附属第三医院：该医院的疼痛科在疼痛疾病的治疗上具有较高水平，包括纤维肌痛综合征。

4. 复旦大学附属华山医院：神经内科在神经系统疾病，包括纤维肌痛综合征的治疗上有着丰富的临床资源。

5. 长沙湘雅医院：其风湿免疫科和疼痛科在湖南地区，对纤维肌痛综合征的治疗有一定优势。

选择医院时还需结合自身地理位置、医保覆盖等因素进行考虑。同时，早期诊断和规范治疗是非常关键的，建议在就医前咨询医生并进行全面评估。