干细胞疗法作为一种新兴的医疗手段，在治疗系统性红斑狼疮（SLE）方面展现出了巨大的潜力。目前，全球多家医疗机构都在进行相关的研究和临床试验，但具体哪家医院拥有成熟的干细胞治疗SLE的系统可能会因地区和研究进度而异。

美国哈佛医学院附属麻省总医院、斯坦福大学医院、约翰霍普金斯医院等都有进行干细胞治疗SLE的研究。在中国，北京协和医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院等大型综合性医院也在积极探索这一领域。这些医院的科研团队在细胞免疫学、基因编辑等方面有着深厚实力，一些临床试验结果显示，干细胞治疗可能有助于减轻症状、抑制自身免疫反应，并在一定程度上改善患者的生活质量。

然而，需要注意的是，干细胞治疗仍处于发展阶段，疗效并非百分之百且可能存在一定的风险和副作用。患者在接受此类治疗前，应咨询专业的医生，详细了解治疗方案、预期效果以及可能的风险。同时，个体差异很大，治疗效果也会有所不同。因此，选择医院时，除了技术实力，医生的经验和患者的综合评估也至关重要。