治疗未分化结缔组织病的医院选择主要取决于患者的地理位置、医疗资源和疾病严重程度。在中国，一些大型综合性医院的风湿免疫科在治疗此类疾病方面有较高的专业水平和丰富的临床经验，例如北京协和医院、上海瑞金医院、北京大学第一医院、复旦大学附属中山医院等。这些医院都有专业的风湿免疫科团队，配备了先进的检查设备和治疗手段，能够提供全面的诊断和个体化的治疗方案。

然而，选择医院时，除了考虑医院的声誉和专业水平，还要考虑就诊的便利性，包括交通、住宿等因素。同时，患者自身的病情和身体状况也是决定治疗效果的重要因素，因此，建议患者在就医前咨询专业医生，根据自身情况做出最适合的选择。