结肠炎是一种炎症性肠病，主要影响大肠（结肠）的黏膜层。其具体原因尚未完全明确，但一般认为是多种因素相互作用的结果，包括：

1. 免疫系统异常：结肠炎的主要类型之一——克罗恩病和溃疡性结肠炎，可能与免疫系统对肠道正常菌群的过度反应有关，导致炎症。

2. 遗传因素：有研究显示，家族中有结肠炎患者的人，患病风险会增加，说明遗传在其中起一定作用。

3. 环境因素：长期暴露于某些环境因素，如化学物质、药物或食物不耐受，可能触发或加重炎症。

4. 感染：虽然不是所有结肠炎都由感染引起，但某些感染（如沙门氏菌、志贺氏菌）可能会引发急性结肠炎。

5. 其他疾病：如炎症性肠病、肠道菌群失调、压力、吸烟等也可能与结肠炎的发生有关。

6. 肠道菌群失衡：肠道内正常菌群与肠道黏膜之间的平衡被打破，可能导致炎症反应。

综合来看，结肠炎的发生是一个复杂的过程，涉及遗传、免疫、环境和微生物等多个层面。治疗通常需要针对个体的具体情况采取综合性的管理策略。