脑栓塞是一种由于血液中的栓子（如血栓、空气泡、脂肪碎片或肿瘤细胞）阻塞脑血管，导致大脑某部分血液供应中断的疾病。其后遗症的发生主要有以下几个原因：

1. 血栓形成：动脉硬化是主要诱因，血管内皮损伤、血脂异常、血小板聚集等因素可能导致血栓形成。

2. 血流动力学变化：栓子阻塞血管时，局部脑组织缺氧，引发脑细胞损伤。

3. 脑组织缺血再灌注损伤：血流恢复时，可能会引起脑细胞进一步损伤，加重神经功能障碍。

4. 神经元凋亡和炎症反应：栓塞后，神经元会经历凋亡过程，同时炎症反应加剧，导致脑损伤。

5. 缺乏康复治疗：如果患者未能得到及时和有效的康复治疗，可能导致肌肉萎缩、运动障碍、认知障碍等后遗症。

因此，预防和早期治疗脑栓塞至关重要，以减少后遗症的发生。