治疗脑萎缩的医院选择主要取决于患者的病情严重程度、所在地区以及医院的专业水平。在中国，一些大型综合性医院和神经内科、神经外科或康复医学科实力较强的医院在脑萎缩的诊疗方面有较高的水平，如北京天坛医院、上海复旦大学附属华山医院、广州中山大学附属第一医院等。

这些医院都有专业的神经内科团队，配备了先进的医疗设备和技术，能够进行详细的神经系统检查和诊断，并提供个性化的治疗方案，包括药物治疗、物理治疗、康复训练等。具体选择还需结合患者的具体情况，如病情、交通便利性等因素综合考虑。

在选择医院时，建议先咨询家庭医生或专业医疗机构，获取专业的医疗建议。同时，保持良好的生活习惯，定期复查，配合医生的治疗，对于脑萎缩的管理也非常重要。