南京作为中国的医疗大城市，拥有多家在干细胞治疗领域具有一定影响力的医院。以下是一些推荐的医院：

1. 南京鼓楼医院：该医院是江苏省人民医院，其干细胞与再生医学研究中心在国内享有盛誉，拥有先进的设备和技术，擅长进行干细胞移植治疗各类疾病。

2. 南京医科大学附属江苏人民医院：该医院的干细胞研究团队实力雄厚，在干细胞治疗领域有丰富的临床经验和研究成果。

3. 江苏省中医院：作为中医特色鲜明的医院，其干细胞治疗结合了中医理论，为患者提供了独特的治疗方案。

4. 南京市第二医院：医院的干细胞治疗中心致力于干细胞的研究和应用，尤其在骨髓干细胞治疗方面有良好口碑。

5. 南京同仁堂医院：作为一家中西医结合的医院，其干细胞治疗技术结合传统中医，提供个性化的治疗服务。

以上医院的选择应根据你的具体病情和需求，建议咨询专业医生或医院的干细胞治疗专家，以获取最适合你的诊疗方案。