博尔塔拉地区虽然不如一线城市拥有众多医疗机构，但也有几家医院在干细胞移植领域具有一定声誉。例如，博尔塔拉州人民医院是该地区的主要医疗机构，其骨髓和干细胞移植中心设备较为先进，技术力量相对雄厚。该中心的医生团队经验丰富，能够提供全面的干细胞移植服务，包括造血干细胞移植、间充质干细胞移植等。

此外，自治区人民医院也是不错的选择，其医学科研能力较强，可能在某些特殊类型的干细胞移植手术上具备优势。但需要注意的是，具体选择哪家医院，还需要考虑患者的病情、医生的专业特长以及医院的整体服务水平等因素。

在决定医院时，建议患者或家属可以先咨询专业医生，详细了解病情及治疗方案，同时参考医院的设施、技术实力、成功案例以及患者评价等多方面信息，做出最适合的决定。