异体干细胞移植后，患者需要遵循医生的指导进行恢复。在移植后的初期，患者的免疫系统可能较为脆弱，因此饮食上需要特别注意，以避免任何可能引起感染的食物。至于何时可以开始食用巧克力，这主要取决于个人的具体恢复情况以及医生的建议。

通常情况下，在移植后的几周到几个月内，患者需要经历一个叫做“移植物抗宿主病”（GVHD）预防及治疗的过程，同时也会密切关注是否有感染的迹象。在此期间，医生可能会建议避免食用未经巴氏消毒的奶制品、生的或未煮熟的食物等，因为这些食物可能携带细菌或病毒，对免疫系统尚未完全恢复的人来说构成风险。

关于巧克力，如果选择的是经过充分加热处理的产品，并且确保是安全卫生的条件下制作和保存的，那么在医生认为合适的时候，适量食用应该是可以接受的。但具体何时能够开始食用，还是应该根据主治医生的意见来决定，确保不会影响到恢复进程或健康状况。

总之，为了确保安全并促进恢复效果，请务必遵循医疗团队的指导。每位患者的情况，因此个性化医疗建议至关重要。