在广西凭祥市，干细胞治疗作为一种新兴的医疗技术，在甲状腺功能减退（简称甲减）等疾病的治疗中展现出了潜力。虽然目前关于该地区干细胞治疗机构的具体排名信息较为有限，但我们可以从一些关键因素来评估和推荐几家在当地口碑较好的医疗机构。这些因素包括但不限于医生的专业背景、治疗设施的现代化程度、患者的实际反馈以及科研成果等。

1. 凭祥市人民医院：作为当地规模较大、设备先进的综合性医院之一，该院内分泌科在甲减等内分泌疾病诊治方面积累了丰富的经验。近年来，该科室也在积极探索干细胞疗法在甲减治疗中的应用。

2. 凭祥市中医院：结合传统中医与现代医学理念，该医院在运用干细胞技术辅助治疗甲减方面也取得了一定成效。其特色在于采用个体化治疗方案，注重整体调理。

3. 其他专业性较强的民营诊所或专科医院：随着医疗技术的发展，一些专注于特定领域研究与治疗的机构也可能提供相关服务。这类机构往往拥有更为前沿的技术手段和更灵活的服务模式。

尽管干细胞治疗具有广阔的应用前景，但在具体实施过程中仍需严格遵循国家法律法规，并在专业医师指导下进行。此外，每位患者的病情不同，适合的治疗方法也会有所差异，因此在接受任何新型治疗前，建议详细咨询并了解相关信息。