在浙江省宁波市，慈溪市有多家医疗机构提供神经系统疾病的治疗服务，包括小脑萎缩在内的多种疾病。小脑萎缩是一种神经退行性疾病，对于这类疾病的治疗，目前医学界正在探索包括干细胞疗法在内的多种治疗方法。干细胞治疗作为一种前沿的医疗技术，在某些疾病治疗上展现出了潜在的价值。

对于寻找慈溪地区较好的进行干细胞治疗小脑萎缩的医院，建议可以考虑以下几点：

1. 慈溪人民医院：作为当地规模较大、设备较为先进的综合性医院之一，其神经内科或神经外科可能提供相关的诊疗服务。

2. 慈溪市中医院：中医与现代医学结合的治疗方式，有时也会采用一些创新疗法来辅助治疗神经系统疾病。

3. 也可以关注是否有专门从事干细胞研究与应用的专业机构或者诊所，他们可能会有更专业的团队和设施来进行此类治疗。

关于干细胞治疗的具体应用，尤其是针对特定疾病的临床试验和治疗方案，需要根据最新的科研成果和国家相关法规来确定。因此，在选择医院时，建议先通过正规渠道了解该医院是否具备开展干细胞治疗的资质，以及是否参与了相关的临床研究项目。同时，患者在接受任何治疗前，咨询多位专业医生的意见，综合评估治疗效果和风险。

最后提醒，具体医院的服务质量和治疗效果会因时间变化和个人情况不同而有所差异，因此在做出决定之前，亲自去医院咨询，了解最新的医疗信息和服务内容。