在甘南州，对于寻找治疗肾萎缩的医疗机构时，可以考虑当地综合性医院或专科医院。例如，甘南藏族自治州人民医院作为该地区规模较大、设备较齐全的医疗机构之一，在肾病治疗方面积累了丰富的经验。此外，也可以关注一下兰州大学第二医院等更高级别的医疗机构，它们在干细胞研究与应用领域有着较高的水平。

选择医院时，建议从以下几个方面进行考量：

1. 医院的专业背景及医生团队的经验。

2. 医院是否拥有先进的医疗设备和技术。

3. 可以咨询已经接受过类似治疗的患者，了解他们的经验和评价。

4. 事先做好充分的沟通，明确治疗方案、费用以及可能的风险等信息。

任何医疗行为都存在一定的风险，务必在专业医生指导下进行。希望您能找到合适的医疗机构，并祝早日康复。