干细胞治疗作为一种前沿的医疗技术，在膝关节疾病的治疗上展现出了一定的应用潜力。如同其他医疗手段一样，干细胞膝关节注射也存在一定的风险与不良反应。常见的不良反应包括但不限于局部不适、轻微肿胀或疼痛，这些通常是暂时性的，随着身体适应会逐渐减轻。

在极少数情况下，可能会发生感染、炎症反应加剧或免疫系统对注入的细胞产生异常反应等较为严重的不良反应。并非所有患者在接受干细胞治疗后都会经历上述不良反应，个体差异较大，具体表现也会有所不同。

重要的是，在考虑接受此类治疗前，患者应与医生充分沟通，详细了解可能的风险和预期效果，根据个人健康状况做出合理选择。同时，选择有资质的医疗机构进行治疗，遵循医嘱，以最大程度地降低潜在风险。

以上信息基于当前医学知识提供，但具体情况仍需结合临床实践和专业医生指导。对于任何医疗决策，建议咨询专业医护人员以获得个性化建议。