间充质干细胞治疗作为一种新兴的医疗技术，近年来在一些特定疾病治疗领域展现出良好的潜力。对于蛋白尿的治疗，虽然间充质干细胞疗法还在不断发展研究阶段，并且其临床应用受到严格的监管和伦理审查，但确实有一些的医疗机构在进行这方面的研究和临床试验。

在中国，例如北京协和医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、广州医科大学附属第一医院等，都有科研团队在进行间充质干细胞治疗相关研究。这些机构通常会根据最新的科学研究进展，对有潜力的治疗方法进行探索和尝试，包括对蛋白尿的治疗。然而，间充质干细胞治疗并非所有蛋白尿患者都适用，且目前在大多数国家和地区，这种治疗方法仍然处于临床试验或研究阶段，并未广泛应用于常规临床实践中。

在选择进行间充质干细胞治疗的医疗机构时，患者应首先考虑该机构是否具有合法的医疗资质、先进的科研设施以及经验丰富的医疗团队。同时，了解治疗的具体流程、预期效果、可能的风险及副作用、以及治疗费用也是十分重要的。

此外，建议患者在决定接受任何治疗前，与专业医生充分沟通，详细了解治疗的适应症、禁忌症、治疗方案、预期效果、可能的风险和副作用、以及治疗后的随访计划等信息。在选择医疗机构时，应优先考虑那些在医学界享有良好声誉、拥有丰富临床经验和良好治疗记录的医院。

总之，在选择进行间充质干细胞治疗蛋白尿的医院时，应当综合考虑医疗机构的专业性、安全性、以及治疗的有效性，同时遵循科学、理性、审慎的原则，以确保治疗的安全性和有效性。