在南通，选择合适的医疗机构进行内分泌失调的干细胞治疗时，可以参考以下几家医院：

1. 南通大学附属医院：作为一所集医疗、教学、科研为一体的大型综合性医院，该医院拥有先进的医疗设备和专业的医疗团队。在内分泌疾病治疗方面积累了丰富的经验。

2. 南通市第一人民医院：这所医院也是南通地区较为知名的医疗机构之一，内分泌科实力较强，拥有一支高水平的医疗队伍，在内分泌系统疾病的诊断和治疗上有着较高的水平。

3. 南通市中医院：这所医院结合传统中医与现代医学技术，对于内分泌失调等慢性病的治疗有其独到之处，深受患者信赖。

4. 南通瑞慈医院：作为一家高端私立医院，它配备了国际先进的医疗设备，并且拥有一支由国内外专家组成的医疗团队，能够为患者提供高质量的医疗服务。

干细胞治疗作为一种新型疗法，在临床应用上仍需谨慎对待，建议您在选择前详细了解相关信息，并遵从医生的专业指导。

考虑到个体差异性，不同患者对治疗方法的反应也会有所不同，因此具体疗效还需根据实际情况而定。