在北京市朝阳区，有多家医疗机构提供干细胞治疗不孕不育的服务。这些机构凭借其专业的医疗团队、先进的医疗技术和优质的医疗服务，在患者中获得了良好的口碑。虽然具体的排名情况会根据不同的评价标准和时间有所变化，但以下是几家医疗机构：

1. 北京协和医院生殖中心：作为国内综合性医院之一，北京协和医院生殖中心在辅助生殖领域有着丰富的经验和卓越的技术水平，为众多不孕不育患者带来了希望。

2. 北京大学第三医院生殖医学中心：该中心拥有一支高水平的专业队伍，采用国际诊疗技术和设备，为不孕不育患者提供个性化的治疗方案。

3. 首都医科大学附属北京妇产医院生殖医学科：作为国内较早开展辅助生殖技术的医疗机构之一，该科室积累了大量的临床经验，帮助许多家庭实现了生育梦想。

4. 中日友好医院生殖医学中心：该中心致力于不孕不育的研究与治疗，引进了多项先进技术和设备，为广大患者提供了高质量的医疗服务。

以上信息仅供参考，具体选择时建议您根据自身实际情况并结合专业医生的意见进行综合考量。同时，请务必选择正规有资质的医疗机构进行治疗，确保医疗安全和效果。