在选择进行结缔组织病干细胞移植的医院时，重要的是要考虑到医院的专业水平、医疗设施、医生的经验以及患者的个人需求。

协和医院在风湿免疫科和血液科领域具有很高的声誉。他们的团队在结缔组织病的诊断和治疗方面积累了丰富的经验，包括干细胞移植在内的多种治疗方法。

瑞金医院在风湿免疫性疾病的研究和治疗上有着深厚的积累，其风湿免疫科在国内享有盛誉。医院拥有一流的医疗设备和技术，为患者提供个性化的治疗方案。

中山一院在风湿免疫科领域有较高的知名度，其在结缔组织病的治疗，包括干细胞移植等先进治疗方式方面也有较好的研究和实践基础。

华西医院在风湿免疫疾病治疗领域拥有先进的技术和丰富的临床经验，特别是在免疫调节和干细胞治疗方面，医院的风湿免疫科团队能够为患者提供高质量的医疗服务。

选择医院时，建议综合考虑医院的专业水平、医生的资质、治疗的成功率、医院的地理位置、交通便利性以及个人经济能力等因素。

咨询医生并详细了解不同治疗方案的利弊，根据自己的具体情况做出最适合的选择。请记得，任何医疗决策都应基于充分的信息和专业医疗建议。