昌吉地区虽然在干细胞移植领域的发展相对较快，但具体的医院选择需要综合考虑医院的专业水平、设备设施、医生团队以及服务质量等多个因素。以下几家医院在昌吉地区可能具有一定的影响力：

1. 昌吉州人民医院：作为自治区级医院，该医院的医疗技术较为先进，可能会有一些干细胞移植的相关诊疗项目。

2. 昌吉州中医医院：如果患者对中医治疗有兴趣，该医院在干细胞研究与应用方面可能有独特的中医特色疗法。

3. 昌吉州肿瘤医院：专长于肿瘤治疗，可能在某些特定类型的干细胞移植手术上具备一定的经验和能力。

然而，最终的选择应根据患者的具体病情、需求以及医院的综合评价来决定。建议患者在就医前咨询专业医生或通过网络查询相关医院的最新动态和患者评价。同时，一定要选择正规医疗机构，确保治疗的安全和有效性。