在选择进行间充质干细胞治疗脑中风后遗症的医院时，建议您考虑以下几个关键因素：

首先确保医院具备国家卫生健康委员会或相应卫生行政机构颁发的医疗机构执业许可证，并且拥有相应的医疗设施和设备。

寻找有经验的神经科医生和干细胞研究团队，他们应具备相关的临床经验和科研成果，能够提供个性化的治疗方案。

了解医院是否采用国际先进的干细胞分离、培养、注射等技术，以及是否有针对脑中风后遗症的专项研究项目。

通过查阅患者的评价和案例，了解治疗的效果和安全性。但需注意，任何治疗结果都可能因个体差异而不同。

确保治疗过程遵循国家法律法规，使用的干细胞来源明确、合法，避免使用未经批准的干细胞来源。

了解医院是否提供长期的康复指导和支持服务，包括物理治疗、心理辅导等，以促进患者的全面恢复。

考虑到治疗期间的交通和住宿问题，选择一个地理位置便利、交通便捷的医院。

在选择医院时，请务必从官方渠道获取信息，避免轻信网络上的非官方宣传。同时，任何医疗决策前，都应该与您的主治医生进行深入讨论，确保治疗方案符合您的健康状况和预期目标。