在重庆市，进行干细胞治疗的医疗机构主要集中在几家大型综合性医院及专业的医疗机构内。这些医院通常具有较为先进的医疗设备、丰富的临床经验和专业的医疗团队，能够提供包括干细胞治疗在内的多种医疗服务。

重庆集医疗、教学、科研于一体的大型综合性医院，在干细胞治疗领域有一定的研究和临床应用基础，尤其是在某些特定疾病的治疗方面有所探索。在多个学科领域具有较高的学术地位和技术水平，其骨科、心血管内科等科室在某些情况下可能会利用干细胞技术进行治疗。

在选择医疗机构时，建议您根据具体病情咨询专业医生，并详细了解各个机构的资质、技术水平、治疗方案、费用以及患者反馈等方面的信息，做出最适合自己的选择。同时，了解医保政策覆盖范围，以及是否支持使用医疗保险支付治疗费用，也是选择医院时的重要考虑因素之一。

在任何医疗决策之前，与专业医生进行详细沟通，确保所选治疗方案的安全性和有效性。