在进行结缔组织病的干细胞移植治疗时，选择合适的医院非常重要。中国各大城市如北京、上海、广州、深圳等地拥有较多高水平的医疗机构，其中不乏在风湿免疫性疾病及造血干细胞移植领域具有丰富经验的医院。以下是一些在这些领域享有较高声誉的医院：

1. 北京大学人民医院：作为国内较早开展干细胞移植的医院之一，其风湿免疫科在结缔组织病的治疗方面积累了丰富的临床经验。

2. 上海交通大学附属瑞金医院：该医院的风湿免疫科在国内外享有盛誉，其干细胞移植中心对于各种自身免疫性疾病包括结缔组织病的治疗有着深入研究。

3. 中山大学附属第一医院：位于广州，该医院的风湿免疫科在临床诊疗、科研教学等方面都有很高的水平，其干细胞移植中心也能够提供高质量的服务。

4. 深圳市第二人民医院：在华南地区，深圳市第二人民医院的风湿免疫科在结缔组织病的诊治上也具有一定的影响力。

选择医院时，建议考虑以下几个因素：

- 医院的专业科室和医生团队的资质与经验。

- 治疗设备和技术的先进性。

- 医院的整体医疗环境和服务质量。

- 患者及其家属的个人需求和偏好，包括地理位置、交通便利性等。

请在选择医院前，通过官方网站或咨询医院相关部门信息，并结合患者的具体情况和医生的建议做出决策。同时，考虑到不同医院的费用、保险覆盖范围以及治疗方案可能有所不同，建议详细了解相关事宜。