在内蒙古进行干细胞疗法的医疗机构选择，应基于专业性、安全性以及患者的个人健康状况来决定。内蒙古地区拥有一定的医疗资源，包括一些三甲医院，这些医院通常具备较为完善的干细胞治疗设施和技术。例如，内蒙古医科大学附属医院、内蒙古自治区人民医院等，它们在干细胞治疗领域可能有相应的研究或临床应用。

进行干细胞治疗时，建议首先咨询专业的医疗团队，了解自己的病情是否适合干细胞治疗，并对治疗的风险、效果、费用等有充分的了解。同时，选择正规的医疗机构进行治疗，确保治疗过程的安全性和有效性。

在选择医疗机构时，可以考虑以下几点：

1. 专业资质：确认该机构是否具有相关领域的专业资质和认证。

2. 技术团队：了解参与治疗的专业医生和科研人员的经验与资质。

3. 治疗方案：询问具体采用的干细胞来源（如自体、异体）、治疗流程及预期效果。

4. 安全性保障：了解机构在治疗过程中的安全措施，包括并发症的预防与应对策略。

5. 患者评价：参考其他患者的治疗经历和反馈，但需保持客观理性，注意区分真实有效信息与潜在的广告宣传。

任何医疗决策都应基于全面的信息收集和专业意见的综合评估。在做出决定前，务必与医疗专业人士深入沟通，确保治疗的选择符合个人的健康需求和期望。