在选择进行干细胞治疗便秘的医疗机构时，确保其正规性和专业性至关重要。首先，应选择有合法执业资质、在国家卫生健康委员会注册备案的医疗机构。这类机构通常拥有完善的医疗设施、经验丰富的医疗团队以及严格的医疗管理制度。

其次，建议咨询具有丰富临床经验和良好口碑的专业医生或医疗机构。可以通过查阅相关医学期刊、专业论坛、患者评价等方式，了解治疗效果和安全性反馈。同时，也可以向已接受过此类治疗的朋友或家人寻求推荐。

在选择过程中，务必警惕虚假宣传和夸大疗效的情况。正规的医疗机构和医生会提供科学、合理的治疗方案，并对可能出现的风险进行充分告知。治疗前，应当详细了解治疗过程、预期效果、可能的副作用及后续管理等方面的信息。

选择医疗机构时，还可以关注其是否参与了相关的科研项目或临床试验，这通常意味着该机构在干细胞研究领域有一定的积累和创新。不过，任何医疗决策都应基于个人健康状况、医生的专业意见以及综合考量，谨慎做出决定。

总之，在选择进行干细胞治疗便秘的医疗机构时，应遵循科学、理性原则，多方考察，确保选择的是正规、专业的医疗机构，以获得安全有效的治疗体验。