关于哪些医院可以进行间充质干细胞治疗结缔组织病的研究，需要明确的是，目前这一领域尚处于临床试验阶段或初期应用阶段，在全球范围内，仅有少数医疗机构具备开展此类治疗的条件和技术。在中国，对于干细胞疗法的监管非常严格，必须在国家卫生健康委员会及药品监督管理局批准的机构内进行。因此，患者在选择时应格外谨慎，确保所选医院具备相应的资质与经验。

以下为部分可能涉及该治疗方法的机构（仅供参考，请以官方公布信息为准）：

1. 北京协和医院：作为国内的综合性三甲医院之一，其免疫科及风湿科在治疗自身免疫性疾病方面有着丰富的经验。近年来，该院也在积极探索包括干细胞在内的多种新型疗法。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：该医院拥有强大的科研实力和临床转化能力，在再生医学与细胞治疗领域处于地位。如果有关于间充质干细胞用于治疗结缔组织病的项目开展，这里是一个值得关注的地方。

3. 中山大学孙逸仙纪念医院：该医院骨科在干细胞研究及应用方面积累了较为丰富的经验，尤其是在利用自体间充质干细胞修复骨骼肌肉系统损伤方面取得了不错的成果。虽然直接应用于结缔组织病的报道较少，但基于其在干细胞领域的深厚基础，未来有可能拓展至相关领域。

4. 广州中医药大学第一附属医院：作为一家集医疗、教学、科研于一体的大型综合性中医医院，该医院在结合传统中医药与现代生物技术治疗疑难杂症方面具有独特优势。考虑到干细胞疗法与中医“扶正固本”理念存在一定契合度，不排除该医院会在特定条件下探索将干细胞技术应用于结缔组织病的可能性。

值得注意的是，尽管间充质干细胞显示出了一定的潜力，但其安全性和有效性仍需通过更多高质量临床试验证实。患者在接受任何新兴疗法前，务必充分了解相关信息，并在专业医生指导下做出决定。同时，建议密切关注机构发布的最新研究成果及政策动态，以便及时获取可靠资讯。