在选择治疗慢性结肠炎的医院时，需要考虑多个因素，包括医院的专业水平、医生的经验、医疗设备的先进程度、服务质量以及患者评价等。干细胞治疗作为一种新型的治疗方法，对于慢性结肠炎的治疗具有一定的潜力，但目前全球范围内还在临床试验阶段，并未广泛应用于常规治疗。以下是一些在干细胞研究和应用方面具有较高声誉的医院，供您参考：

1. 北京大学人民医院：作为国内医疗机构，北京大学人民医院在消化内科领域有着深厚的底蕴，同时也在干细胞研究方面有一定的成就。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：瑞金医院在消化系统疾病的诊治上有着丰富的经验，且有专门的干细胞研究中心，开展了一系列的干细胞临床研究项目。

3. 浙江大学医学院附属第一医院：该医院在消化内科和干细胞研究方面都有较高的专业水平，是全国重点学科。

4. 美国约翰斯·霍普金斯医院：作为全球医疗机构，约翰斯·霍普金斯医院在干细胞研究领域处于地位，对慢性炎症性肠病的治疗有深入的研究。

5. 美国斯坦福大学医学中心：斯坦福大学在干细胞科学和生物技术方面有深厚的基础，其医疗中心在慢性疾病治疗上也有诸多创新尝试。

6. 德国慕尼黑大学医院：德国在干细胞治疗领域也有很高的研究水平，慕尼黑大学医院是欧洲医疗中心，其消化内科和干细胞研究所的实力不容忽视。

7. 加拿大多伦多大学医学中心：多伦多大学在干细胞研究领域有世界的地位，其医学中心在慢性疾病治疗上也进行了大量的研究。

尽管这些医院在干细胞治疗方面有研究和探索，但目前慢性结肠炎的干细胞治疗仍处于临床试验阶段，治疗效果和安全性还需要更多的临床数据支持。在接受任何治疗前，建议您与医生充分沟通，了解治疗的风险和可能的收益，并确保治疗是在合法和伦理的框架下进行。同时，也要关注国家卫生健康部门对干细胞治疗的相关政策和指导。