解密基因调控的空间密码是理解基因表达调控复杂性的关键一步。

在基因组中，转录因子通过特定序列的结合位点调控基因表达，但不同TFs在基因启动子和增强子中的结合位点常呈现出相似组合，这些位点如何编码多重基因表达程序仍是重要研究课题。

研究表明，TFs对转录起始的影响具有位置依赖性，即TFs结合位点的空间配置决定了其在基因调控中的作用。

例如，NRF1、NFY和Sp1等经典激活因子在不同转录起始位点的功能取决于其精确位置，既能激活也能抑制转录起始。

通过自然遗传变异、内源性TF蛋白水平扰动及大规模并行分析，科学家们揭示了TFs结合位点的偏好位置如何影响其转录活性。这些发现不仅揭示了基因调控的复杂性，还说明DNA序列多态性可能导致转录变异和疾病。

解密基因调控的空间密码不仅有助于理解基因表达的精确调控机制，还为研究非编码DNA突变如何导致疾病提供了新的视角和方法。这一领域的研究不仅推动了基础生物学的进步，也为疾病治疗提供了潜在的靶点。